由於申請參與租金補貼，要填報租屋資料，最讓房東害怕的就是，租屋資料被鍵入政府檔案，導致被追稅，加上許多是套房或頂加蓋出租，房東更擔心租屋資料曝光，會被當成違建拆除，租屋族也抱怨租金補貼是看得到吃不到。
為了讓房東安心，7月開放租金補貼申請後，內政部將和財政部共同舉辦記者會，宣導房東參與租金補貼成為公益出租人的優點，包括綜合所得稅每月免稅額最高1萬5,000元、房屋稅比照自住住家用稅率1.2％、地價稅比照自用住宅稅率千分之二課徵。
據了解，內政部與財政部已有默契，公益出租人資料不會作為查稅依據，呼籲房東安心出租房屋。
過去因住宅法的限制，只有合法住宅可以申請租金補貼。考量社會弱勢和年輕人，可能只能負擔頂樓加蓋、小套房的租金，因此這次租金補貼以專案形式辦理，讓居住在頂加、小套房的租屋族也可以申請租金補貼方案，只要填寫好地址，相關單位就會去勾稽稅籍資料進行審核。
對於房東擔心頂加、套房資料被公開，可能會被當違建拆除，官員表示，公益出租人的資料，不會跟建管單位連結，這些不合法房子並不用擔心被拆。